密码科学与技术专业定位培养富有社会责任感和创新精神、基础理论扎实、专业知识宽厚、能系统地应用密码科学与技术的基本理论、知识、技能与方法分析和解决复杂工程问题的拔尖创新人才和行业领军人才；具备良好的团队沟通能力和一定的领导才能，具备国际化视野和跨文化的交流、竞争与合作能力；具有终身学习能力，在工作岗位上能够通过自学方式进一步丰富和加深对密码专业知识的学习和理解，自我提升工作能力。

专业基础课包括：程序设计基础、离散数学、数据结构与算法设计、程序设计方法与实践、计算机组成与结构、操作系统、数据库原理与设计、计算机网络、网络空间安全导论、矩阵分析、组合数学、汇编语言与逆向工程、信号与系统、数字逻辑与数字系统等；专业核心课包括：密码学、混沌密码、信息论与编码、数论与近世代数、密码协议、对称密码学、公钥密码学、密码工程实现、信息安全与对抗技术、可信计算理论与技术、软件安全技术、大数据安全与隐私保护、密码分析学、商用密码应用与安全评估、区块链技术、量子密码、密码法律与法规、密码算法的侧信道分析等。